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向極微觀深入,拓展對生命科學(xué)的認(rèn)知

本報(bào)記者 喻思南
2024年09月23日08:00 | 來源:人民網(wǎng)-人民日報(bào)
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在中國科學(xué)院生物物理研究所生物大分子重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,紀(jì)偉在調(diào)試光電關(guān)聯(lián)顯微鏡。喻思南攝

在中國科學(xué)院生物物理研究所生物大分子重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,紀(jì)偉在調(diào)試光電關(guān)聯(lián)顯微鏡。喻思南攝

頭發(fā)絲,大約是肉眼可見的極限,它的直徑約100微米,細(xì)胞是頭發(fā)絲的1/10,細(xì)胞核則只有幾微米。然而,這小小的細(xì)胞核,承載著海量的高價(jià)值遺傳信息。

研究細(xì)胞精細(xì)結(jié)構(gòu),增進(jìn)對生命的認(rèn)識,必須向極微觀尺度深入。

“從群體生態(tài)學(xué)到生命個體、器官、組織、細(xì)胞,再到生物大分子,甚至生物大分子中的原子細(xì)節(jié),生命科學(xué)涉及從宏觀到微觀的多尺度研究。”中國科學(xué)院生物物理研究所研究員、生物大分子重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室研究組長高璞說,作為當(dāng)代生命科學(xué)的重要前沿,生物大分子是典型的極微觀研究領(lǐng)域。

在極微觀尺度,科學(xué)家如何做研究?如何才能把握極微觀科學(xué)研究趨勢?記者進(jìn)行了采訪。

借助先進(jìn)精密觀測技術(shù),從分子尺度“看”細(xì)胞

走進(jìn)生物大分子重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,紀(jì)偉正在指導(dǎo)學(xué)生調(diào)試光電關(guān)聯(lián)顯微鏡。前不久,這位中國科學(xué)院生物物理研究所研究員、生物大分子重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室研究組長帶領(lǐng)團(tuán)隊(duì),基于光電關(guān)聯(lián)顯微鏡,開發(fā)了一種新的觀測方法。

“研究生物大分子,首先要‘看’到它!奔o(jì)偉告訴記者,核酸、蛋白質(zhì)等生物大分子組裝結(jié)構(gòu)復(fù)雜精密,對它們觀察得越清晰,對生命奧秘才能了解得越深刻。

17世紀(jì),荷蘭科學(xué)家用自制的顯微鏡,第一次觀察到單細(xì)胞生物,打開了微生物學(xué)的大門。此后約300年里,光學(xué)顯微鏡不斷發(fā)展,但分辨率因受衍射限制,達(dá)到幾百納米后就很難突破。21世紀(jì)初,隨著超分辨熒光顯微鏡和冷凍電鏡的出現(xiàn),科學(xué)家得以在幾十納米到零點(diǎn)幾納米尺度上觀察亞細(xì)胞結(jié)構(gòu),極大拓展了對生命科學(xué)的認(rèn)知視野。

隨著對微觀結(jié)構(gòu)探索日益深入,科學(xué)家持續(xù)改進(jìn)觀測技術(shù),挑戰(zhàn)顯微鏡“微”之極限。

對著電腦屏幕顯示的細(xì)胞結(jié)構(gòu),紀(jì)偉介紹:為“看”清細(xì)胞里的精細(xì)結(jié)構(gòu),科學(xué)家要觀察特定的分子狀態(tài)。然而,冷凍電鏡電子束只能透過約200納米的生物樣品成像,需要將數(shù)微米厚的細(xì)胞減薄后觀察,但這種減薄具有隨機(jī)性,無法確保目標(biāo)分子保留在切片里。為實(shí)現(xiàn)定向目標(biāo)減薄細(xì)胞,紀(jì)偉團(tuán)隊(duì)研發(fā)出冷凍熒光導(dǎo)航減薄技術(shù),這相當(dāng)于給冷凍雙束電鏡安裝了“導(dǎo)航定位系統(tǒng)”,可以高效地實(shí)現(xiàn)目標(biāo)導(dǎo)向減薄。

圍繞生物大分子研究前沿,生物大分子重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室主要布局生物大分子精密觀測技術(shù)、生物大分子精確組裝原理和生物大分子精準(zhǔn)調(diào)控設(shè)計(jì)三方面研究!皩ι锎蠓肿佣,這三方面研究分別對應(yīng)觀測它、理解它、利用它,在邏輯上密切關(guān)聯(lián)、相互促進(jìn)!备哞闭f。

紀(jì)偉主要研發(fā)生物大分子精密觀測技術(shù),高璞主要研究的是生物大分子精確組裝原理。“生物大分子及復(fù)合體是一切生命活動的執(zhí)行者,這些分子機(jī)器活動出了問題,往往會引發(fā)疾病!备哞备嬖V記者,有了精密的觀測技術(shù),科學(xué)家就能更好地研究生物大分子的有序組裝及動態(tài)調(diào)控,搞清楚了這一過程,就能幫助科學(xué)家做好生物大分子精準(zhǔn)調(diào)控設(shè)計(jì),從而提出有效的應(yīng)對策略。

比如,面對異常核酸信號,宿主是如何進(jìn)行免疫應(yīng)答,以及該過程是如何受到調(diào)控的?借助先進(jìn)的生物大分子研究方法,高璞帶領(lǐng)團(tuán)隊(duì)在該領(lǐng)域取得了一系列突破性進(jìn)展,增進(jìn)了人們對核酸免疫應(yīng)答機(jī)制的理解。向極微觀深入,在生物大分子重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,這樣的重要成果還有不少。

生物大分子重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室近年圍繞三個方向產(chǎn)出了多項(xiàng)前沿研究成果。在精密觀測技術(shù)方面,通過突破光學(xué)和電子顯微成像的時空分辨率,實(shí)現(xiàn)光電關(guān)聯(lián)成像,引領(lǐng)超分辨顯微成像和生物電鏡前沿技術(shù)的發(fā)展;在精確組裝原理方面,揭示了光合作用、感染免疫、細(xì)胞器動態(tài)等多個重要生命過程中一系列全新的生物大分子組裝調(diào)控原理;在精準(zhǔn)調(diào)控設(shè)計(jì)方面,圍繞新型疫苗設(shè)計(jì)、新藥研發(fā)、納米酶設(shè)計(jì)應(yīng)用等方面取得了一系列重要突破。

“生物大分子研究是培育發(fā)展新質(zhì)生產(chǎn)力的重要手段!备哞备嬖V記者,作為生命醫(yī)學(xué)研究的制高點(diǎn),生物大分子研究正在變革藥物、疫苗研發(fā)范式,未來市場規(guī)模巨大,潛在經(jīng)濟(jì)價(jià)值很高,“不論是引領(lǐng)科學(xué)前沿,還是為研發(fā)藥物和創(chuàng)新疫苗提供技術(shù)基礎(chǔ),生物大分子研究都是我們需要重視的關(guān)鍵領(lǐng)域!

從分子層面闡釋作物性狀形成的調(diào)控機(jī)理,帶來育種方式革新

“瞧,這是水稻幼苗根尖細(xì)胞一個切面的照片。仔細(xì)觀察這張照片,我們能看到在突變體的細(xì)胞內(nèi),細(xì)胞壁形成物質(zhì)的運(yùn)輸出現(xiàn)了問題,對這種現(xiàn)象深入研究,就可能找到調(diào)控水稻莖稈發(fā)育的新基因。”在中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所(以下簡稱“農(nóng)科院作科所”)的透射電子顯微鏡室,程治軍指著照片向記者解釋。

程治軍是農(nóng)科院作科所研究員,也是該所萬建民院士領(lǐng)導(dǎo)的水稻功能基因組研究創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)成員之一。在納米尺度,觀察不同材料樣品的形態(tài)和結(jié)構(gòu),已經(jīng)是萬建民團(tuán)隊(duì)開展功能基因研究不可缺少的技術(shù)環(huán)節(jié)。

程治軍告訴記者,水稻有5萬多個基因,功能各不相同,水稻品種之間的“高矮胖瘦”,抗病、抗旱能力,品質(zhì)、口感等特性差異,都源于基因型之間的差異。想篩選出優(yōu)異的水稻品種,常規(guī)育種方法是在親本雜交的基礎(chǔ)上,根據(jù)大田表現(xiàn),對后代表現(xiàn)型分離的單株進(jìn)行選擇。為了保證選出來的單株具有優(yōu)異的性狀,需要多年多點(diǎn)觀察和試驗(yàn),耗時長,且對表現(xiàn)型容易受環(huán)境影響性狀的改良效率較低!坝N更像一門藝術(shù),這一過程比較依靠經(jīng)驗(yàn),缺少針對性!

功能基因組研究為水稻育種提供了新方法!肮δ芑蚪M研究重點(diǎn)關(guān)注基因的表達(dá)調(diào)控及其與環(huán)境的應(yīng)答機(jī)制等,研究的是‘基因如何工作’。”萬建民團(tuán)隊(duì)成員、農(nóng)科院作科所研究員任玉龍說。

從微觀著手,通過分子設(shè)計(jì),有目的地聚合關(guān)鍵性狀基因,優(yōu)化目標(biāo)品種的基因型,定向培育品種是未來高效育種之路。

通過功能基因組研究方法,科研人員能夠從理解基因入手,有針對性選育品種。比如,腎臟病患者不能食用可吸收蛋白含量高的稻米,科研人員便可以找到水稻中調(diào)控蛋白的基因,再通過誘變等方法,培育可吸收蛋白含量低的水稻。未來,科研人員可以通過分子設(shè)計(jì)的方式,精準(zhǔn)地設(shè)計(jì)和培育需要的品種。

萬建民是國內(nèi)較早提出和實(shí)踐水稻分子設(shè)計(jì)育種的科學(xué)家。在國內(nèi),萬建民帶領(lǐng)團(tuán)隊(duì)很早就布局功能基因組研究。經(jīng)過多年持續(xù)攻關(guān),團(tuán)隊(duì)挖掘了一批水稻重要農(nóng)藝性狀關(guān)鍵基因,研究成果有力推動了水稻功能基因組領(lǐng)域的原始創(chuàng)新,為水稻產(chǎn)業(yè)發(fā)展提供了科技支撐。其中,攻克“水稻雜種不育”難題是代表成果之一。

秈稻多種植于南方,粳稻多種植于北方。兩者之間的遺傳差異較大,雜種優(yōu)勢明顯。據(jù)測算,如果秈稻和粳稻亞種間能育成超級雜交稻,預(yù)計(jì)可比現(xiàn)有雜交水稻增產(chǎn)15%以上。然而,秈粳雜種存在結(jié)實(shí)率低等問題,這一生殖隔離現(xiàn)象阻礙了雜種優(yōu)勢的利用。

怎么辦?從分子層面入手,萬建民帶領(lǐng)團(tuán)隊(duì)歷經(jīng)30年潛心研究,闡明了水稻種間和種內(nèi)“雜種不育”的分子機(jī)理,破解了水稻生殖隔離之謎。該突破被譽(yù)為水稻雜種不育領(lǐng)域的里程碑式成果,為生產(chǎn)上利用秈粳雜種優(yōu)勢奠定了理論基礎(chǔ)。

“保障國家糧食安全,關(guān)鍵在農(nóng)業(yè)科技創(chuàng)新。”任玉龍說,從農(nóng)作物功能基因組研究的角度提出解決方案和應(yīng)對的策略,有助于應(yīng)對我國糧食生產(chǎn)中面臨的重大問題,特別是社會經(jīng)濟(jì)結(jié)構(gòu)轉(zhuǎn)型時期的農(nóng)業(yè)可持續(xù)發(fā)展和糧食安全問題。

適應(yīng)極微觀科學(xué)研究趨勢,做更多科學(xué)前沿的原創(chuàng)性工作

“向極微觀深入是探究物質(zhì)世界、生命本質(zhì)及運(yùn)行規(guī)律的重要途徑!敝袊茖W(xué)技術(shù)發(fā)展戰(zhàn)略研究院科技與經(jīng)濟(jì)社會發(fā)展研究所所長陳志說,由于微觀層面的重大突破往往引發(fā)顛覆性技術(shù)變革,相關(guān)研究成為國際關(guān)注焦點(diǎn)。

生物大分子、功能基因組學(xué)研究等有何趨勢?

受訪專家表示,我國生物大分子研究積累比較深厚,其中,中國科學(xué)院生物物理研究所生物大分子重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室是國內(nèi)外公認(rèn)的前沿研究重要基地和學(xué)術(shù)高地。當(dāng)前,生物大分子研究向更微觀的領(lǐng)域挺進(jìn),對精密觀測技術(shù)的要求將越來越高。“我們要開發(fā)更精密的觀測技術(shù),與國際同行一起,努力推動生物大分子觀測從靜態(tài)、體外觀測向動態(tài)、原位觀測升級!奔o(jì)偉說。

研究向極微觀深入,多學(xué)科交叉融合日益重要。“生物大分子研究涉及數(shù)學(xué)、化學(xué)、物理學(xué)、生物學(xué)等不同專業(yè)的人才,營造鼓勵合作的氛圍,讓科研人員圍繞若干重大科學(xué)問題,發(fā)揮各自特長,取長補(bǔ)短就能實(shí)現(xiàn)1+1>2的效果,推動我國相關(guān)研究邁上新臺階!奔o(jì)偉說。

任玉龍告訴記者,隨著研究的深入,功能基因組學(xué)將更加注重跨學(xué)科交叉。生物學(xué)、農(nóng)學(xué)、計(jì)算機(jī)科學(xué)、數(shù)學(xué)等多領(lǐng)域的知識將相互融合,共同推動功能基因組學(xué)的發(fā)展。

推動農(nóng)作物功能基因組學(xué)研究,種質(zhì)資源是重要載體。國家農(nóng)作物種質(zhì)資源庫保存著9萬多份水稻種質(zhì)資源。任玉龍說,水稻品種的每次更新迭代都離不開重大基因資源的發(fā)掘與利用。未來,團(tuán)隊(duì)將努力挖掘水稻重要農(nóng)藝性狀形成的關(guān)鍵基因,闡明其功能,構(gòu)建高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)等性狀形成的分子調(diào)控網(wǎng)絡(luò),切實(shí)把資源優(yōu)勢轉(zhuǎn)化為創(chuàng)新優(yōu)勢、產(chǎn)業(yè)優(yōu)勢。

向極微觀深入,意味著研究的多是科學(xué)前沿的原創(chuàng)性工作。受訪專家普遍建議,適應(yīng)極微觀科學(xué)研究趨勢,把握未來科技創(chuàng)新發(fā)展主動權(quán),應(yīng)進(jìn)一步加強(qiáng)對優(yōu)秀團(tuán)隊(duì)的穩(wěn)定支持,讓科研人員安心做基礎(chǔ)研究。

“科研儀器需要在迭代中不斷升級完善,且必須要大家擰成一股繩。經(jīng)過磨合搭配好的團(tuán)隊(duì)要保持穩(wěn)定,才能持續(xù)出成果!奔o(jì)偉告訴記者,“要給予科研人員更多的信任、更長的支持周期,鼓勵他們‘十年磨一劍’做重大研究。”

程治軍認(rèn)為,基礎(chǔ)研究做得好,分子育種的根基才更堅(jiān)實(shí),這往往需要長時間的積累。眼下,農(nóng)業(yè)科研資助周期仍相對較短,給基礎(chǔ)研究的空間還不夠,“希望給予一批優(yōu)秀團(tuán)隊(duì)長期穩(wěn)定支持,鼓勵他們探索有價(jià)值的研究!

《 人民日報(bào) 》( 2024年09月23日 18 版)

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(責(zé)編:李慧博、孫娜)

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